Samuel Soares percorreu todas as equipas da Formação do Benfica: Infantis, Iniciados, Juvenis, Juniores, Sub-23 e Equipa B, alcançando títulos de Campeão Nacional em Juvenis e em Iniciados.
Na fase final da época 2021/22, o guarda-redes celebrou o sucesso do Benfica na UEFA Youth League.
Internacional Sub-21 português, Samuel Soares iniciou a época 2022/23 com um total de quase três dezenas de jogos em representação das seleções jovens.