Samuel Soares est passé par toutes les équipes de formation du Benfica : U-13, U-15, U-17, U-19, U-23 et puis l’équipe B, obtenant des titres de champion national en U-15 et U-17.
Lors de la phase finale de la saison 2021/22, le gardien de but a célébré le succès du Benfica en UEFA Youth League.
L'international portugais U-21, Samuel Soares, a commencé la saison 2022/23 avec un total de près de trois douzaines de matchs en représentant les équipes nationales de jeunes.